Applet roubando o foco de um modal html

Olá galera,
Estou com o seguinte problema:
Tenho uma aplicação que utiliza applet e devido a utilização de um componente de upload que é desenvolvido utilizando java script e componentes gráficos do bootstrap, tive a necessidade de implementar a integração do Java com o Java Script ou seja um um botão no meu applet assim que pressionado executa chamada para uma função java script, está função chama um modal utilizando o bootstrap, até ai tudo normal o problema acontece quando o modal é aberto.
Quando o modal é exibido o applet está ficando por cima do modal, já tentei resolver utilizando a função z-index do css no modal, mas não resolveu alguém já possou por isso ou tem alguma solução?
Observação: estou utilizando a tag Object para referenciar o applet na tela.
Desde já agradeço a todos.
Obrigado.